Qui sommes-nous?
Le LIS est une équipe de l’UMR 7205 (CNRS, MNHN, UPMC, EPHE) Institut de Systématique, Évolution et Biodiversité .
Personnel du LIS
Permanents :
- Sylvain BOUQUIN (IE SU)
- Thierry BOURGOIN (Pr MNHN)
- Marc PIGNAL (IR MNHN)
- Rémy PORTIER (IR CNRS, UMS BBEES)
- Régine VIGNES LEBBE (Pr SU)
- René ZARAGUETA i BAGILS (MC SU)
Contractuels :
- Nicolas BEKKOUCHE (ATER SU)
- Sylvain MORIN (ingénieur informatique, GBIF)
Doctorants (thèse en cours) :
- Maya Sahraoui (2020…), encadrants R. Vignes Lebbe (ISYEB) et Vincent Guigue (ISIR)
- Elie Saliba (2020-2023), encadrantes R. Vignes Lebbe (ISYEB) et Anne-Marie Ohler (ISYEB)
- Manon Bucher (2020…), encadrant T. Bourgoin (ISYEB)
- Maxime Le Cesne (2022…), encadrant T. Bourgoin (ISYEB)
- Dieu Nguyen Khac (2022…), encadrants My Hanh Diep Thi (Vietnam), Marc Pignal (ISYEB) et Régine Vignes Lebbe (ISYEB)
Doctorants (thèses soutenues) :
- Mathilde DELAUNAY (PHD 2015-2019), encadrants R. Vignes Lebbe et Romain Nattier) « Comment faciliter l’identification de l’entomofaune ? Développement, tests et analyses de clés d’identification numériques. » (HAL Id : tel-02868459, version 1;
- Julien TROUDET (PHD 2017, co-direction R. Vignes Lebbe et Frédéric Legendre) « Gradients de diversité terrestre : le message de la systématique à travers les bases de données de biodiversité » (HAL Id : tel-01901059, version 1;
- Adeline KERNER (PHD 2013, Sous la direction de Régine Vignes-Lebbe et de Philippe Janvier;
- Anaïs GRAND (PHD 2013); sous la direction de Régine Vignes-Lebbe et de René Zaragüeta Bagils
- Visotheary RIVIERE UNG (PHD 2013); sous la direction de Régine Vignes-Lebbe, René Zaragüeta y Bagils et de David M. Williams
- Stéphane PRIN (PHD 2012); Sous la direction de Thierry Bourgoin, René Zaragüeta Bagils, Régine Vignes Lebbe
- Bouziane Khalloufi (PHD 2010); Sous la direction de Hervé Lelièvre et de René Zaragüeta Bagils.
- Nathanael CAO (PHD 2008); Sous la direction de Hervé Lelièvre et de René Zaragüeta Bagils.
- Guillaume ROUSSE (PHD 2003); Sous la direction de Régine Vignes-Lebbe et de Noël Conruyt. « Vers une ontologie de la systématique : les objets-métiers du domaine. »
- Jérôme BARBEAU (PHD 2003, sous la direction de T. Poynard, Paris V et R. Vignes Lebbe). « Acquisition de nouveaux descripteurs à partir d’images. »
- Robert BOSSY (PHD 2002); Sous la direction de Régine Vignes-Lebbe. « Edition coopérative de bases de données scientifiques. »
- Laurent GUEGUEN (PHD 2000, sour la direction de Jacques Lebbe et R. Vignes Lebbe) « Partitionnement maximalement prédictif sous contrainte d’ordre total. Applications aux séquences génétiques. »
Stagiaires :
- Marie-Lou PORCHER (M2, 2021-2022)
- Godefroy GIGNOUX (M2, 2021-2022)
- Doriane CAZALS (M1, 2021-2022)
- Tancrède BOURGEOIS (M1, 2021-2022)
- Elie SALIBA (M2, 2019-2020)
- Arthur BERNARD (M2, 2019-2020)
- Teddy GAIDDON (M1, 2018-2019) “Proposition d’une typologie des caractéristiques du vivant dans le contexte du biomimétisme”
- Roseline DUPUYAU (M2, année 2018-2019) “ : Valorisation des descriptions taxonomiques informatisées : exploitation des métadonnées des bases Xper3”
- Roseline DUPUYAU (M1, année 2017-2018) “ Conception d’un prototype de moteur de recherche pour Xper3” ;
- Artémis Korniliou (Master 2 SEP)
- Yue ZHU (stage 3eme année Ecole Polytechnique, 2017) ;
- Florian PELLEN (M2, année 2017-2018) “ Modélisation des descriptions taxonomiques dans un langage du web sémantique : traduction automatique Xper-OWL” ;
- Gaetan DELTOUR (M2, année 2016-2017) ;
- Diane DABIR (M1, année 2016-2017) “Evolution des méthodes phylogénétiques” ;
- Amélie PINEL (M1, année 2016-2017) “Bilan et analyse des bases de connaissances xper3” ;
- Fiora DOMINICI (Master 2 SEP, stage coencadré par N. Nebout, V. Lebreton et R. Vignes Lebbe)
- Cassandre EVEN (M1, année 2015-2016) “clé d’identification des lémuriens de Madagascar” ;
- Cindy LIM (M2 SEP 2014-2015) Co- encadrement avec S. Aragon (MC, SU). “La Bio-informatique au service de l’enseignement universitaire : Informatisation et utilisation participative de la collection de zoologie de l’UPMC” ;
- Aurélien MAIRE (Master 2 SEP, stage coencadré par Frédérique Jiguet et R. Vignes Lebbe)
- Julien TROUDET (Master 2 SEP, stage coencadré par Olivier Gargominy du SPN et R. Vignes Lebbe)
- Kathleen JACQUEZ (Master 2 SEP, stage coencadré par Philippe Bearez et R. Vignes Lebbe)
- Léa BLED (Master 2 SEP, stage au sein de NatureParif, coencadré par M. Kayadjanian et R. Vignes Lebbe)
- Aurélien MAIRE (Master 1 Bioinfo, P7, stage au sein du GBIF France, encadré par R. Vignes Lebbe)
Anciens membres du LIS :
- Adrien SAINT SARDOS (postdoc, CEEBIOS)
- Estelle BOURDON (CDD recherche)
- Fabienne AUDEBERT (MC SU)
- Santiago ARAGON (MC SU)
- Antoine BERGAMASCHI (IE, CDD)
- Thomas BURGUIERE (IE, CDD)
- Florian CAUSSE (IE UPMC)
- Frédéric LISON (TCS RF UPMC)
- Nils PAULHE (IE, CDD)
- Gilles PETIT (MC UPMC)
- Visotheary RIVIERE UNG (IE CNRS)
- Vincent ROLLAND (CDD – développement Spipoll/Mkey)
- Cyril GALLUT (MC P6)
- Guillaume SAUVENAY (IE P6)
- Antoine CHALUBERT (doctorant)
- Bernard LEPEN (IE P6)